Protein–RNA interactions for Protein: Q99N85

Mrps18a, 28S ribosomal protein S18a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps18aQ99N85 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrps18aQ99N85 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrps18aQ99N85 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms