Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SrrtQ99MR6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SrrtQ99MR6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms