Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nkd1Q99MH6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms