Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gtpbp4Q99ME9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms