Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcc1Q99LI2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms