Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms