Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DhddsQ99KU1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DhddsQ99KU1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms