Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf19Q99KP6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms