Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Reep3Q99KK1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reep3Q99KK1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms