Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TrabdQ99JY4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TrabdQ99JY4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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TrabdQ99JY4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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TrabdQ99JY4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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TrabdQ99JY4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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TrabdQ99JY4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TrabdQ99JY4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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