Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lims1Q99JW4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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