Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu1Q99J10 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu1Q99J10 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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