Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim7Q923T7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms