Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trim59Q922Y2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms