Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpe65Q91ZQ5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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Rpe65Q91ZQ5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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