Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Basp1Q91XV3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Basp1Q91XV3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms