Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx11Q91WL6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms