Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Setd3Q91WC0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Setd3Q91WC0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Setd3Q91WC0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Setd3Q91WC0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Setd3Q91WC0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Setd3Q91WC0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Setd3Q91WC0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Setd3Q91WC0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms