Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hdac11Q91WA3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms