Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usb1Q91W78 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usb1Q91W78 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms