Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capn8Q91VA3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms