Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc71Q8VEG0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc71Q8VEG0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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