Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sft2d2Q8VD57 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sft2d2Q8VD57 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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