Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trpm8Q8R4D5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms