Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ClmpQ8R373 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ClmpQ8R373 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms