Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnaaf4Q8R368 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaaf4Q8R368 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms