Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Impg1Q8R1W8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Impg1Q8R1W8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Impg1Q8R1W8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms