Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg10Q8R1P4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms