Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Treml1Q8K558 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Treml1Q8K558 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms