Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hecw1Q8K4P8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms