Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OptnQ8K3K8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms