Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cdk5rap2Q8K389 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cdk5rap2Q8K389 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms