Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c1Q8K193 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c1Q8K193 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms