Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Pkn3Q8K045 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pkn3Q8K045 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pkn3Q8K045 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pkn3Q8K045 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Pkn3Q8K045 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pkn3Q8K045 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms