Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sh2d5Q8JZW5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms