Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sphk1Q8CI15 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms