Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Setd1bQ8CFT2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Setd1bQ8CFT2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Setd1bQ8CFT2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms