Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms