Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc9Q8CDN9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc9Q8CDN9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms