Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nsun3Q8CCT7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms