Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nrip1Q8CBD1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nrip1Q8CBD1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms