Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms