Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc90bQ8C3X2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms