Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Iffo1Q8BXL9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Iffo1Q8BXL9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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