Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp38Q8BW70 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp38Q8BW70 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms