Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms