Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cxcl16Q8BSU2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl16Q8BSU2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cxcl16Q8BSU2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Cxcl16Q8BSU2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl16Q8BSU2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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