Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Bicd1Q8BR07 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Bicd1Q8BR07 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms