Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cnpy4Q8BQ47 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cnpy4Q8BQ47 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms