Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gga3Q8BMI3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gga3Q8BMI3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms